从事植物分类、分子系统发育、生物地理学和生物多样性保护研究。

主要从事鸟类系统演化、谱系生物地理、特殊环境适应的比较基因组以及禽流感溯源与病源生态等方面研究。今后的研究重点将集中探讨如下几个问题:鸟类特有化与多样性生物地理格局的形成与维持机制、鸟类谱系分化与新种形成机制、鸟类适应环境变化的比较基因组及适应性进化机制。

被子植物重要类群的分子系统学以及北半球生物地理间断研究; 我国喜马拉雅和横断山区高山植物区系的细胞地理学研究;

动物区系与系统学

传粉生物学、孢粉学

植物适应性演化及资源利用

物种濒危机制与群体遗传学

植物分类学、植物系统与分子进化、植物生态(分子生态)、资源植物保护与利用、自然科技资源平台建设、天然产物开发、生物安全与外来入侵植物等研究

系统与进化植物学,分子生态学(植物适应性进化的遗传机制)

主要从鸟类多样性与地理分布、物种进化关系、谱系地理格局、适应性进化等方面开展研究,重点探讨山地和高原环境对当地鸟类物种分化、遗传多样性与适应性进化的影响。取得的主要研究结果如下:1,高原鸟类的分布格局与系统发育研究:发现高原东部地区是中国特有鸟类的分布中心;高原及周边山脉的隆起导致许多中国特有鸟类的起源和分化。2,高原鸟类的比较谱系地理研究:阐述了“冰期避难地”对高原东北部地区(祁连山)鸟类遗传特有性的维持与保护;揭示了“演化岛”的隔离与稳定是形成高原东南部地区(西南山地)鸟类遗传多样性与特有性的机制。3